Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnal1Q05A62 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms