Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms