Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms