Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sox8Q04886 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms