Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl7Q03366 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl7Q03366 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccl7Q03366 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms