Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msx2Q03358 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms