Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms