Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms