Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gjb4Q02738 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb4Q02738 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb4Q02738 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb4Q02738 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb4Q02738 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb4Q02738 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb4Q02738 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb4Q02738 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb4Q02738 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb4Q02738 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb4Q02738 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb4Q02738 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb4Q02738 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb4Q02738 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb4Q02738 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb4Q02738 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms