Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snai1Q02085 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms