Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RykQ01887 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RykQ01887 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RykQ01887 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RykQ01887 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RykQ01887 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RykQ01887 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RykQ01887 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RykQ01887 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RykQ01887 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RykQ01887 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RykQ01887 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RykQ01887 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RykQ01887 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RykQ01887 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RykQ01887 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RykQ01887 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RykQ01887 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RykQ01887 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RykQ01887 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RykQ01887 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RykQ01887 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RykQ01887 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RykQ01887 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RykQ01887 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RykQ01887 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RykQ01887 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RykQ01887 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RykQ01887 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RykQ01887 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RykQ01887 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RykQ01887 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RykQ01887 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RykQ01887 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RykQ01887 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RykQ01887 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RykQ01887 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RykQ01887 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RykQ01887 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RykQ01887 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RykQ01887 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RykQ01887 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RykQ01887 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RykQ01887 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RykQ01887 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RykQ01887 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RykQ01887 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RykQ01887 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RykQ01887 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RykQ01887 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RykQ01887 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RykQ01887 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RykQ01887 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RykQ01887 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RykQ01887 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RykQ01887 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RykQ01887 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RykQ01887 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RykQ01887 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RykQ01887 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RykQ01887 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RykQ01887 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RykQ01887 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RykQ01887 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RykQ01887 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RykQ01887 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RykQ01887 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RykQ01887 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RykQ01887 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RykQ01887 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RykQ01887 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RykQ01887 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RykQ01887 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RykQ01887 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RykQ01887 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RykQ01887 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RykQ01887 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RykQ01887 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RykQ01887 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms