Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms