Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cacna1cQ01815 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms