Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gja5Q01231 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gja5Q01231 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms