Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SeleQ00690 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SeleQ00690 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeleQ00690 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeleQ00690 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SeleQ00690 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms