Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga4Q00651 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms