Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms