Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx2Q00262 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Stx2Q00262 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms