Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbp10Q000W5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms