Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gfra1P97785 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms