Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nbr1P97432 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nbr1P97432 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms