Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TgfbiP82198 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms