Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx2P81066 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx2P81066 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx2P81066 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Irx2P81066 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx2P81066 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx2P81066 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx2P81066 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx2P81066 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx2P81066 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx2P81066 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx2P81066 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx2P81066 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms