Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Polr1bP70700 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr1bP70700 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms