Protein–RNA interactions for Protein: P70436

Dlx4, Homeobox protein DLX-4, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dlx4P70436 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dlx4P70436 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms