Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Usp9xP70398 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp9xP70398 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp9xP70398 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp9xP70398 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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