Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Traf5P70191 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf5P70191 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf5P70191 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf5P70191 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf5P70191 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf5P70191 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf5P70191 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf5P70191 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf5P70191 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Traf5P70191 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf5P70191 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf5P70191 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf5P70191 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf5P70191 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf5P70191 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf5P70191 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf5P70191 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf5P70191 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf5P70191 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf5P70191 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf5P70191 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf5P70191 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf5P70191 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Traf5P70191 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf5P70191 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Traf5P70191 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms