Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SbdsP70122 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SbdsP70122 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SbdsP70122 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SbdsP70122 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SbdsP70122 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms