Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gabrb3P63080 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabrb3P63080 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabrb3P63080 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabrb3P63080 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabrb3P63080 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabrb3P63080 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabrb3P63080 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabrb3P63080 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabrb3P63080 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabrb3P63080 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabrb3P63080 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabrb3P63080 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabrb3P63080 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabrb3P63080 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabrb3P63080 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabrb3P63080 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabrb3P63080 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabrb3P63080 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabrb3P63080 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabrb3P63080 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabrb3P63080 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 571.8 ms