Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra1P62812 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra1P62812 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra1P62812 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra1P62812 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra1P62812 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra1P62812 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra1P62812 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra1P62812 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra1P62812 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra1P62812 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra1P62812 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra1P62812 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra1P62812 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra1P62812 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra1P62812 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra1P62812 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra1P62812 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gabra1P62812 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra1P62812 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra1P62812 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra1P62812 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra1P62812 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra1P62812 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra1P62812 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra1P62812 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gabra1P62812 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra1P62812 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra1P62812 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra1P62812 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra1P62812 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra1P62812 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra1P62812 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra1P62812 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabra1P62812 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabra1P62812 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra1P62812 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra1P62812 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra1P62812 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra1P62812 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra1P62812 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra1P62812 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra1P62812 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra1P62812 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra1P62812 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabra1P62812 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gabra1P62812 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms