Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snrpd1P62315 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms