Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme3P61290 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme3P61290 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme3P61290 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme3P61290 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme3P61290 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psme3P61290 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme3P61290 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme3P61290 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme3P61290 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme3P61290 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms