Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf13P61216 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf13P61216 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf13P61216 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf13P61216 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf13P61216 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms