Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CirbpP60824 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CirbpP60824 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CirbpP60824 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CirbpP60824 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CirbpP60824 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CirbpP60824 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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