Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhbdl3P58873 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhbdl3P58873 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms