Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rp1P56716 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rp1P56716 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rp1P56716 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rp1P56716 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rp1P56716 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rp1P56716 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rp1P56716 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rp1P56716 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rp1P56716 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rp1P56716 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rp1P56716 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rp1P56716 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rp1P56716 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rp1P56716 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rp1P56716 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rp1P56716 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms