Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp5P56399 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp5P56399 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp5P56399 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp5P56399 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp5P56399 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp5P56399 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp5P56399 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms