Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rrp1P56183 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms