Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms