Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp1P52624 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp1P52624 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp1P52624 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp1P52624 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp1P52624 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upp1P52624 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp1P52624 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp1P52624 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Upp1P52624 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp1P52624 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp1P52624 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp1P52624 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp1P52624 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp1P52624 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms