Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClgnP52194 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClgnP52194 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ClgnP52194 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClgnP52194 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClgnP52194 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ClgnP52194 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ClgnP52194 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms