Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd7P50283 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd7P50283 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd7P50283 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd7P50283 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd7P50283 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd7P50283 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd7P50283 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd7P50283 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms