Protein–RNA interactions for Protein: P49183

Dnase1, Deoxyribonuclease-1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnase1P49183 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnase1P49183 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnase1P49183 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms