Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GdnfP48540 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GdnfP48540 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GdnfP48540 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GdnfP48540 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GdnfP48540 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GdnfP48540 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GdnfP48540 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GdnfP48540 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GdnfP48540 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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