Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rfx1P48377 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rfx1P48377 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rfx1P48377 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rfx1P48377 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Rfx1P48377 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rfx1P48377 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rfx1P48377 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rfx1P48377 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rfx1P48377 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rfx1P48377 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx1P48377 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx1P48377 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx1P48377 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx1P48377 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx1P48377 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx1P48377 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx1P48377 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx1P48377 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx1P48377 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx1P48377 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx1P48377 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx1P48377 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx1P48377 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms