Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgfaP48030 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgfaP48030 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TgfaP48030 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TgfaP48030 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TgfaP48030 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TgfaP48030 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TgfaP48030 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms