Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax7P47239 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax7P47239 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax7P47239 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pax7P47239 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax7P47239 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax7P47239 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax7P47239 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms