Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TesP47226 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TesP47226 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TesP47226 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TesP47226 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TesP47226 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TesP47226 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TesP47226 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TesP47226 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TesP47226 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TesP47226 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TesP47226 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TesP47226 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TesP47226 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TesP47226 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TesP47226 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TesP47226 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TesP47226 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TesP47226 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TesP47226 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TesP47226 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TesP47226 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TesP47226 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TesP47226 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TesP47226 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TesP47226 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TesP47226 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TesP47226 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TesP47226 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TesP47226 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TesP47226 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TesP47226 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TesP47226 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TesP47226 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TesP47226 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TesP47226 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TesP47226 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TesP47226 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TesP47226 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TesP47226 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TesP47226 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TesP47226 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TesP47226 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TesP47226 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TesP47226 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TesP47226 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TesP47226 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TesP47226 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TesP47226 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TesP47226 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TesP47226 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TesP47226 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TesP47226 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TesP47226 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TesP47226 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TesP47226 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TesP47226 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TesP47226 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TesP47226 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TesP47226 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TesP47226 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TesP47226 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TesP47226 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TesP47226 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TesP47226 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TesP47226 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TesP47226 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TesP47226 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TesP47226 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TesP47226 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TesP47226 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TesP47226 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TesP47226 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TesP47226 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TesP47226 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TesP47226 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TesP47226 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TesP47226 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TesP47226 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TesP47226 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms