Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clec3bP43025 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clec3bP43025 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms