Protein–RNA interactions for Protein: P43024

Cox6a1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a1P43024 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6a1P43024 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms